Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms