Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms