Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn1P97789 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms