Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme1P97371 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psme1P97371 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms