Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms