Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Smchd1Q6P5D8 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Smchd1Q6P5D8 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Smchd1Q6P5D8 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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