RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7
Cldn9, Claudin-9, mouse
Predictions only
Length
217 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Cldn9
Q9Z0S7
Gm20888-201
ENSMUST00000178934
567 nt
TSL 5
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm21650-201
ENSMUST00000179073
567 nt
TSL 5
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm20937-201
ENSMUST00000180329
567 nt
TSL 5
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm44419-201
ENSMUST00000203338
229 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
AC154296.2-201
ENSMUST00000214696
545 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
AC154994.1-201
ENSMUST00000217395
302 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24476-201
ENSMUST00000157437
131 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm37763-201
ENSMUST00000193445
120 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm34015-201
ENSMUST00000194908
451 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Olfr1478-ps1-201
ENSMUST00000208393
391 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
DQ267101-201
ENSMUST00000082562
73 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23412-201
ENSMUST00000083017
107 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Mir654-201
ENSMUST00000104787
84 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22814-201
ENSMUST00000157452
104 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23536-201
ENSMUST00000157541
134 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23101-201
ENSMUST00000157550
137 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23994-201
ENSMUST00000158059
88 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Mir1931-201
ENSMUST00000158589
119 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25949-201
ENSMUST00000175333
114 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Mir6389-201
ENSMUST00000183661
102 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Mir468-201
ENSMUST00000197332
78 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm29818-201
ENSMUST00000218070
165 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
AC132437.1-201
ENSMUST00000218308
320 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
AC115735.2-201
ENSMUST00000227135
351 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25855-201
ENSMUST00000082787
72 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Mir324-201
ENSMUST00000083600
89 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23039-201
ENSMUST00000083870
161 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Mir362-201
ENSMUST00000093592
65 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24375-201
ENSMUST00000104397
132 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23531-201
ENSMUST00000104567
68 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm13711-201
ENSMUST00000119708
453 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24747-201
ENSMUST00000157835
87 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23665-201
ENSMUST00000158054
62 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22163-201
ENSMUST00000158408
135 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Mir1961-201
ENSMUST00000158643
112 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Mir15a-201
ENSMUST00000175266
84 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm21903-201
ENSMUST00000178039
90 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm44063-201
ENSMUST00000203307
376 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22364-201
ENSMUST00000083097
98 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Mir141-201
ENSMUST00000083540
72 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25643-201
ENSMUST00000158874
103 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26194-201
ENSMUST00000175036
71 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Olfr1401-ps1-201
ENSMUST00000202296
211 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm45738-201
ENSMUST00000203645
233 nt
TSL 5
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm44976-201
ENSMUST00000205543
261 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
CT030166.3-201
ENSMUST00000223203
193 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23605-201
ENSMUST00000157255
127 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22200-201
ENSMUST00000158614
67 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26285-201
ENSMUST00000177923
107 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Mir6364-201
ENSMUST00000183396
86 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Olfr865-ps1-201
ENSMUST00000212071
85 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23622-201
ENSMUST00000082460
107 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23242-201
ENSMUST00000083055
107 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Mir216a-201
ENSMUST00000083605
72 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Snord33-201
ENSMUST00000083694
84 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22021-201
ENSMUST00000104353
107 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm16265-201
ENSMUST00000134558
108 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24909-201
ENSMUST00000157290
280 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23278-201
ENSMUST00000157911
143 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23020-201
ENSMUST00000158766
253 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25838-201
ENSMUST00000158920
120 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm27980-201
ENSMUST00000184094
169 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm28435-201
ENSMUST00000185496
108 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm28256-201
ENSMUST00000188953
139 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm28559-201
ENSMUST00000190532
139 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Nbdy-205
ENSMUST00000208235
132 nt
APPRIS P2
TSL 2
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm45508-201
ENSMUST00000209298
299 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22809-201
ENSMUST00000082743
156 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22421-201
ENSMUST00000083058
107 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Zfp654-201
ENSMUST00000052588
4741 nt
APPRIS P3
TSL 1 (best)
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23203-201
ENSMUST00000104374
107 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Scgb1b23-ps-201
ENSMUST00000116009
252 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22709-201
ENSMUST00000116893
111 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm14301-201
ENSMUST00000120181
324 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24381-201
ENSMUST00000122697
104 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm28849-201
ENSMUST00000188127
174 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm20923-201
ENSMUST00000190009
319 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm21088-201
ENSMUST00000190875
316 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm42988-201
ENSMUST00000198116
225 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
AC132615.1-201
ENSMUST00000213873
255 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26207-201
ENSMUST00000082909
104 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26495-201
ENSMUST00000083152
137 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
n-R5s73-201
ENSMUST00000122508
107 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
n-R5s70-201
ENSMUST00000122650
116 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Mir3079-201
ENSMUST00000175428
90 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26236-201
ENSMUST00000175536
137 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm44948-201
ENSMUST00000209050
149 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
AC147101.2-201
ENSMUST00000219756
184 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
AC164297.5-201
ENSMUST00000224365
198 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
n-R5s183-201
ENSMUST00000083939
115 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24000-201
ENSMUST00000158063
89 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Vmn2r-ps20-201
ENSMUST00000179853
382 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm30155-201
ENSMUST00000223458
339 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24258-201
ENSMUST00000083739
133 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22048-201
ENSMUST00000104721
89 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26255-201
ENSMUST00000122492
103 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23466-201
ENSMUST00000157133
106 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23982-201
ENSMUST00000157141
106 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25558-201
ENSMUST00000158083
106 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22088-201
ENSMUST00000158341
117 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
First
Previous
748
Next
Last
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.1 ms