Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn19Q9ET38 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cldn19Q9ET38 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms