Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Spta1P08032 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Spta1P08032 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Spta1P08032 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.7 ms