Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ctu2Q3U308 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ctu2Q3U308 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ctu2Q3U308 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ctu2Q3U308 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ctu2Q3U308 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ctu2Q3U308 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ctu2Q3U308 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ctu2Q3U308 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms