Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ctu2Q3U308 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ctu2Q3U308 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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