Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
H2-M10.4Q85ZW8 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
H2-M10.4Q85ZW8 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217 ms