Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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Cldn19Q9ET38 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
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Cldn19Q9ET38 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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Cldn19Q9ET38 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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Cldn19Q9ET38 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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Cldn19Q9ET38 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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Cldn19Q9ET38 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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Cldn19Q9ET38 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
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Cldn19Q9ET38 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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Cldn19Q9ET38 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn19Q9ET38 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn19Q9ET38 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.1 ms