Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms