Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Card11Q8CIS0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Card11Q8CIS0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Card11Q8CIS0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Card11Q8CIS0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Card11Q8CIS0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Card11Q8CIS0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Card11Q8CIS0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Card11Q8CIS0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms