Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms