Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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