Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms