Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms