Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb41P48193 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms