Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms