Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms