Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms