Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctu2Q3U308 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu2Q3U308 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.4 ms