Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cldn19Q9ET38 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.3 ms