Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn19Q9ET38 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms