Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd2Q149F1 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd2Q149F1 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd2Q149F1 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd2Q149F1 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rpusd2Q149F1 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms