Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn19Q9ET38 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms