Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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Cldn19Q9ET38 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn19Q9ET38 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cldn19Q9ET38 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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Cldn19Q9ET38 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn19Q9ET38 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.6 ms