Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Smchd1Q6P5D8 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Smchd1Q6P5D8 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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