Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cldn19Q9ET38 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.4 ms