Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.8 ms