Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms