Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot1Q6ZQ08 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms