Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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NipblQ6KCD5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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NipblQ6KCD5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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