Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Knl1Q66JQ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.3 ms