Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms