Protein–RNA interactions for Protein: P52623

Uck1, Uridine-cytidine kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uck1P52623 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uck1P52623 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uck1P52623 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms