Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm5cP41230 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5cP41230 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms