Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhoP15409 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RhoP15409 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RhoP15409 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RhoP15409 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RhoP15409 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RhoP15409 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhoP15409 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhoP15409 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoP15409 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms