Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prf1P10820 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms