Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f6O54917 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2f6O54917 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms