Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms