Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 340.2 ms