Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Smchd1Q6P5D8 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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