Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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Cldn19Q9ET38 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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Cldn19Q9ET38 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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Cldn19Q9ET38 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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Cldn19Q9ET38 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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Cldn19Q9ET38 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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Cldn19Q9ET38 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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Cldn19Q9ET38 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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Cldn19Q9ET38 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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Cldn19Q9ET38 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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Cldn19Q9ET38 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
Cldn19Q9ET38 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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Cldn19Q9ET38 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn19Q9ET38 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.1 ms