Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Rpusd2Q149F1 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rpusd2Q149F1 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rpusd2Q149F1 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rpusd2Q149F1 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rpusd2Q149F1 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rpusd2Q149F1 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rpusd2Q149F1 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rpusd2Q149F1 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rpusd2Q149F1 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rpusd2Q149F1 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Rpusd2Q149F1 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rpusd2Q149F1 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rpusd2Q149F1 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rpusd2Q149F1 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rpusd2Q149F1 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rpusd2Q149F1 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rpusd2Q149F1 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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