Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Rpusd2Q149F1 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rpusd2Q149F1 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.4 ms