Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rpusd2Q149F1 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.4 ms