Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2surpQ6NV83 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms